生物柴油可用作锅炉、涡轮机、柴油机等的燃料，工业上应用的主要是脂肪酸甲酯。是一种清洁柴油，可从生物质提炼，在资源日益枯竭的今天，有望取代石油成为替代燃料。
它是许多大型车辆如卡车及内燃机车及发电机等的主要动力燃料，其具有动力大，价钱便宜的优点，
生物柴油的需求量很大，应用的主要问题是“冒黑烟”，菠萝蜜视频网站经常在马路上看到冒黑烟的卡车。冒黑烟的主要原因是燃烧不完全，对空气污染严重，如产生大量的颗粒粉尘，CO2排放量高等。
原理：为了增加生产效率，采用酶固定化方法，并在反应过程中分段添加甲醇，有利于增加生产效率。这种固定化酶是来自一种假丝酵母，由它与载体一起制成反应柱用于生产，控制温度30℃，转化率较高。这种脂酶连续使用100天仍不失活。反应液经过几次反应柱后，将反应物静置，并把甘油分离出去，就可以直接将其用作生物柴油。
